Rapid
determination of the genetic differences between some oyster samples observed
in the Aegean Sea that were assumed as an invasive species and domestic oyster
(Ostrea edulis, Linnaeus 1758) using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)-
PCR (Polymerase Chain Reaction) markers was aimed in this study. In this
regard, domestic species samples and the other samples collected from Altınoluk
coasts which were morphologically different than Ostrea species and were
showing similarities to Crassostrea genus were genetically indetified by using
8 RAPD profiles. Total 343 bands were observed in the study. Polymorphism rate
was found higher in the samples that might belong to Crassostrea genus. 6 of
all loci considered in this study were found highly identical for these
species. Total of 16 species-spesific diagnostic bands: 11 bands for the
invasive species and 5 bands for the domestic species, were determined.
Bu çalışmada, Ege
Denizi’nde gözlemlenen ve istilacı tür olduğu düşünülen bazı istiridye
örnekleriyle, yerli istiridye türü olan Ostrea edulis (Linnaeus 1758) örnekleri
arasındaki genetik farklılıkların tespitinin, RAPD (Rastgele Çoğaltılmış
Polimorfik DNA)-PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yardımıyla hızlı bir şekilde
belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu bağlamda, denizlerimizin yaygın türü olan Ostrea
genusundan morfolojik olarak farklı olduğu gözlenen ve Crassostrea genusuna ait
özellikler gösteren istiridye bireyleriyle, yerli tür 8 adet RAPD profili
kullanılarak genetik olarak ayırt edilmiştir. Çalışmada toplam 343 bant elde
edilmiştir. Polimorfizm oranı Crassostrea sp.’ye ait örneklerde daha yüksek
bulunmuştur. Ele alınan lokuslardan 6 tanesinin ayrım gücü yüksek çıkmıştır.
İstilacı türe ait 11, yerli türe ait 5 adet toplamda 16 adet türe-özgü
diagnostik bant belirlenmiştir.
Bölüm | Makaleler |
---|---|
Yazarlar |
|
Yayınlanma Tarihi | 21 Şubat 2017 |
Gönderilme Tarihi | 4 Ekim 2016 |
Yayınlandığı Sayı | Yıl 2017Cilt: 34 Sayı: 1 |