Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu.

İhsan Yaşa; Özge Kahraman; Ebru Tekin; Ali Koçyiğit

EN TR

Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu.

Öz

Ekstrem halofilik mikroorganizmalar yüksek tuz koşullarında yaşamaya adapte olmuş bu nedenle biyoteknoloji alanında ilgi gören canlılardır. Bu araştırmada İzmir Çamaltı Tuzlası’ndan alınan örneklerden ekstrem halofilik archaea izolasyonu gerçekleştirilerek bu mikroorganizmaların biyokimyasal testlerinin yanı sıra moleküler karakterizasyonları yapılmıştır. 16S rDNA analizleri sonucu 1, 4, 6, 7, 10, 11, 13 nolu izolatlar %99 oranında Haloferax alexandrinus, 5 nolu izolat %98 oranında Haloferax alexandrinus, 12 nolu izolat %96 benzerlik oranıyla Haloferax alexandrinus, 3 nolu izolat %99 Haloferax sp. HSC4, 8 nolu izolat %97 Haloferax YT 228, 2 nolu izolat %99 Halobacterium salinarum R1 strain, 9 nolu izolat %97 Halobacterium salinarum olarak tanılanmıştır

Anahtar Kelimeler

Ekstrem halofilik mikroorganizmalar, Çamaltı tuzlası, archaea, 16S rDNA, moleküler identifikasyon

Kaynakça

Asha K. R. T., D. A. J Vinitha., S.G. Kiran, W.A. Manjusha, N. Sukumaran, J. Selvin. 2005. Isolation and Cultivation of Halophilic Archaea from Solar Salterns Located in Peninsular Coast of India. The Internet Journal of Microbiology.. Volume 1 Number 2.
Asker, D., Y Ohta. 2002. Haloferax alexandrinus sp. nov., an extremelyhalophilic canthaxanthin-producing archaeon from a solar saltern in Alexandria (Egypt) International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52: 729:738
Bhatnagar T., S. Boutaiba, H. Hacene, J.-L Cayol., M.-L. Fardeau, B. Ollivier, J. C. Baratti. 2005. Lipolytic activity from Halobacteria: Screening and hydrolase production. FEMS Microbiology Letters 248: 133-140
Birbir, M., C. Sesal. 2003. Extremely Halophilic Bacterial Communities in Şereflikoçhisar Salt Lake in Turkey Turk J Biol 27: 7-22
Birbir M., A. Ogan, B. Çallı, B. Mertoğlu. 2004. Enzyme characteristics of extremely halophilic archaeal community in Tuzkoy Salt Mine, Turkey. World Journal of Microbiology & Biotechnology 20: 613–621
Birbir M., B. Çallı, B. Mertoğlu, R. Bardavid, A. Oren, M. Öğmen, A. Ogan. 2007. Extremely Halophilic Archaea From Tuz Lake, Turkey, and the Adjacent Kaldırım and Kayacık Salterns. World Journal of Microbiology and Biotechnology 23: 309-316
Cuadros-Orellana S., M. Pohlschröder, L.R. Durrant. 2006. Isolation and characterization of halophilic archaea able to grow in aromatic compounds. International Biodeterioration & Biodegradation 57:151–154
Dyall-Smith M. 2006. The Halohandbook- Protocols for Haloarchaeal Genetics, Version 6.01. http://www.haloarchaea.com/resources/halohandbook/index.html

Dyall-Smith M. 2008. The Halohandbook- Protocols for Haloarchaeal Genetics, Version 7.0. http://www.haloarchaea.com/resources/halohandbook/index.html
Dussault H.P. 1955. An improved technique for stainin red halophilic bacteria. J. Bacteriol. 70: 484-485
Elder B. L., I. Trujillo, D. J. Blazevic. 1977. Rapid Deoxyribonuclease Test with Methyl Green. Journal Of Clinical Microbiology, 6:312-313
Elshahed M. S., F. Z. Najar, A. R. Bruce, A. Oren, A. D. Thomas, R. L. Krumholz. 2004. Survey of Archaeal Diversity Reveals an Abundance of Halophilic Archaea in a Low-Salt, Sulfide- and Sulfur-Rich Spring, Applied And Environmental Microbiology, Apr. 70: 2230–2239
Gerhardt P., R.G.E Murray, W.A. Wood, N.R Krieg. 1994. Methods for General and Molecular Bacteriology., American Society For Mcrobiology. P. 159-169
Gruber C., A. Legat, M. Pfaffenhuemer, C. Radax, G. Weidler, H.-J. Busse, H. Stan-Lotter. 2004. Halobacterium noricense sp. nov., an archaeal isolate from a bore core of an alpine Permian salt deposit, classification of Halobacterium sp. NRC-1 as a strain of H. salinarum and emended description of H. Salinarum Extremophiles 8:431–439
Hezayen F. F., B. J. Tindall, A. Steinbüchel, B. H. A. Rehm. 2002. Characterization of a novel halophilic archaeon, Halobiforma haloterrestris gen. nov., sp. nov., and transfer of Natronobacterium nitratireducens to Halobiforma nitratireducens comb. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52, 2271–2280
Holmes, M. L., and M. L. Dyall-Smith. 1991. Mutations in DNA gyrase results in novobiocin resistance in halophilic archaebacteria. J. Bacteriol. 173:642–648.
Horikoshi K., W.D. Grant(ed). 1998. Ekstremophiles, Chapter 4 Halophiles( W.D. Grant, R. T. Gemmel, T. J. Mcgennity), Wiley-Sons Inc.New York, 93-133
Kanlayakrit W., P. Bovornreungroj, T. Oka and M. Goto. 2004. Production and Characterization of protease from an Extremely Halophilic Halobacterium sp. PB407 Natural sciences 38: 15-20
Koru, E. 2004. Artemia and it’s importance in Çamaltı Saltworks (Izmir, Turkey) ecosystem (in Turkish). E.Ü. Su Ürünleri Dergisi 21: 187-189
Kushner D.J. 1978. Life in High salt and solute concentrations:halophilic bacteria. İn
Kushner D.J. (ed) Microbial Life İn Extreme Environments. London:Academic Pres, 317-368
Kushner D.J. 1993. Growth and nutrition of halophilic bacteria in Vreeland RH Hochstein L (eds): The Biology of Halophilic Bacteria .Boca Raton:FL CRC Press , pp 87-103
Le Borgne S., D. Paniagua, R. Vazquez-Duhalt. 2008. Biodegradation of Organic Pollutants by Halophilic Bacteria and Archaea J Mol Microbiol Biotechnol 15:74–92
Wistreich, G.A. ve Lechtman, M.D. 1980. Laboratory Exercieses in Microbiology 4 th edition , USA
Martin, S., M. C. Marquez, C. Sanchez-Porro, E. Mellado, D. R. Arahal, A. Ventosa. 2003. Marinobacter lipolyticus sp. nov., a novel moderate halophile with lipolytic activity International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53: 1383-1387
Montalvo-Rodriguez R., A. Ruiz-Acevedo, J. Lopez-Garriga. 1997. New Isolates of Extremely Halophilic Archaebacteria (Halobacteria) from Puerto Rico and the Caribbean. Caribbean Journal of Science, 33:98– 104
Montalvo-Rodriguez, R., R. H. Vreeland, A. Oren, M. Kessel, C. Betancourt, J. Lopez-Gariga. 1998. Halogeometricum borinquense gen. nov., sp. nov., a novel halophilic archaeon from Puerto Rico. İnt. J. of Syst. Bacteriol., 48; 1305- 1312
Nieto J. J., R. Fernandez-Castillo, M. C. Marquez. A. Ventosa, E. Quesada, F. Ruiz-Berraquero. 1989. Survey of Metal Tolerance in Moderately Halophilic Eubacteria. Applied and Environmental Microbiology 55: 2385- 2390
Obayashi, A., N. Hiraoka, K. Kita, H. Nakajima and T. Shuzo. 1988. US Patent 4: 724, 209, US Cl. 435/199.
Oren A., A. Ventosa, W. D. Grant. 1997. Proposed Minimal Standards for Description of New Taxa in the Order Halobacteriales İnternetional Journal of Systematic Bacteriology 47: 233-238
Oren A. 2006. The Order Halobacteriales. Dworkin, M. (ed.). The Prokaryotes: Chapter 8, 3: 113-164
Sanchez-Porro C., S. Martin, E. Mellado, A. Ventosa. 2003. Diversity of moderately halophilic bacteria producing extracellular hydrolytic enzymes. J Appl Microbiol, 94:295-300
Stan-Lotter H., M. Pfaffenhuemer, A. Legat, H.-J. Buse, C. Radax, C. Gruber. 2002. Halococcus dombrowskii sp. nov., an archaeal isolate from a Permian alpine salt deposit International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52:1807–1814
Yaşa İ., A. Kılınç. 2002. Pamuk Liflerinden İzole Edilen Selülaz Üreticisi Fungusların Selülaz Aktivitelerinin Belirlenmesi, Ç.Ü. Ziraat Fakültesi Dergisi, 17 (3), 57-62
Wieland, F., W. Dompert, G. Bernhardt, and M. Sumper. 1980. Halobacterial glycoprotein saccharides contain covalently linked sulphate. FEBS Lett. 120:110–114
Van den Burg B. 2003. Extremophiles as a source for novel enzymes. Current Opinion in Microbiology. 6:213–218.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

-

Bölüm

-

Yazarlar

İhsan Yaşa

Özge Kahraman

Ebru Tekin

Ali Koçyiğit

Yayımlanma Tarihi

1 Haziran 2008

Gönderilme Tarihi

7 Aralık 2015

Kabul Tarihi

-

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2008 Cilt: 25 Sayı: 2

IZ

https://izlik.org/JA42WD93SY

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

APA

Yaşa, İ., Kahraman, Ö., Tekin, E., & Koçyiğit, A. (2008). Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu. Ege Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 25(2), 117-121. https://izlik.org/JA42WD93SY

Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu.

Isolation and molecular identification of extreme halophilic archaea from Çamaltı Saltern.

Abstract

Keywords

Çamaltı Tuzlasından Ekstrem Halofilik Archaea İzolasyonu ve Moleküler Karakterizasyonu.

Öz

Anahtar Kelimeler

Kaynakça

Ayrıntılar

Birincil Dil

Konular

Bölüm

Yazarlar

Yayımlanma Tarihi

Gönderilme Tarihi

Kabul Tarihi

Yayımlandığı Sayı

IZ

Kaynak Göster